Τα όργανα διοίκησης του Τμήματος είναι η Συνέλευση, η Γενική Συνέλευση Ειδικής Σύνθεσης (ΓΣΕΣ) και ο Πρόεδρος.

Η Συνέλευση καταρτίζει το πρόγραμμα προπτυχιακών σπουδών, παρακολουθεί την καλή εφαρμογή του, φροντίζει για τον εξοπλισμό και τα περιουσιακά στοιχεία του Τμήματος και επιλύει τα ακαδημαϊκά ή και διοικητικά θέματα που προκύπτουν. Η Γενική Συνέλευση Ειδικής Σύνθεσης (ΓΣΕΣ) είναι αρμόδια να λαμβάνει αποφάσεις για όλα τα θέματα μεταπτυχιακών σπουδών του Τμήματος. Ο Πρόεδρος του Τμήματος είναι αρμόδιος να συγκαλεί τη Συνέλευση και τη ΓΣΕΣ, να μεριμνά για την εφαρμογή των αποφάσεων της Συνέλευσης.

Το ανώτατο όργανο του Τμήματος είναι η Συνέλευση στην οποία συμμετέχουν:

  • όλα τα μέλη ΔΕΠ,
  • ένας εκπρόσωπος των προπτυχιακών φοιτητών,
  • ένας εκπρόσωπος των μεταπτυχιακών φοιτητών,
  • ένας εκπρόσωπος των μελών ΕΤΕΠ/ΕΔΙΠ του Τμήματος.